Allelhäufigkeit-Rechner

Ein Allelhäufigkeit-Rechner wandelt Zählungen homozygot dominanter, heterozygoter und homozygot rezessiver Individuen in die beiden Allelfrequenzen eines diploiden zweialleligen Locus um. In der üblichen Unterrichtsnotation sind das p für das dominante Allel und q für das rezessive, und sie addieren sich stets zu eins, weil jede Genkopie das eine oder das andere Allel ist. Geben Sie die drei Genotypzählungen einer Populationsstichprobe ein. Das Werkzeug zählt zwei Kopien von jedem Homozygoten und je eine jedes Allels von jedem Heterozygoten, teilt durch die doppelte Stichprobengröße und liefert p, q sowie die stützenden Allelzählungen.

Was Allelhäufigkeit ist und wie p und q aus Genotypen gezählt werden

Allelhäufigkeit ist der Anteil der Genkopien an einem Locus, die ein bestimmtes Allel tragen. An einem diploiden zweialleligen Locus steuert jedes Individuum zwei Kopien bei: ein dominant homozygotes Individuum zwei dominante Allele, ein rezessiv homozygotes zwei rezessive, und ein Heterozygot je eines. Sind AA, Aa und aa die drei Genotypzählungen und N ihre Summe, enthält die Stichprobe 2N Genkopien.

Die dominante Häufigkeit ist daher p gleich (2 mal AA plus Aa) geteilt durch 2N, und die rezessive ist q gleich (2 mal aa plus Aa) geteilt durch 2N. Diese beiden Identitäten sind keine Extraannahme: sie sind eine Zählung der Allele, die Sie bereits bewertet haben. Sie zwingen außerdem p plus q auf eins; ein Ergebnis, das nicht zu eins addiert, deutet auf eine entfallene Zählung oder auf eine Phänotyptafel hin, die für eine Genotyptafel gehalten wurde.

Dieser Rechner beschränkt sich auf beobachtete Genotypzählungen. Er kehrt keine rezessive Phänotyphäufigkeit unter Hardy–Weinberg um, um q als Quadratwurzel des aa-Anteils zu raten, und er prüft nicht, ob die Stichprobe p-Quadrat, 2pq und q-Quadrat entspricht. Das sind andere Suchabsichten: die eine schätzt eine unsichtbare Aufteilung, die andere ist ein Anpassungstest.

Hier sind die drei Klassen bereits getrennt, sodass die einzige Rechnung die gewichtete Allelzählung ist. Ein durchgerechneter Unterrichtsfall ist 320 AA, 160 Aa und 20 aa: N ist 500, es gibt 1000 Genkopien, 800 davon sind dominant, und die Häufigkeiten sind p gleich 0.8 und q gleich 0.2. Eine weitere Lehrbuchteilung von 16, 48 und 36 in einer Stichprobe von 100 ergibt p gleich 0.4 und q gleich 0.6.

Null ist eine zulässige Zählung für eine fehlende Klasse, aber alle drei Nullen werden abgelehnt, weil eine Häufigkeit undefiniert ist, wenn niemand gezählt wurde.

Wo ein Allelhäufigkeit-Rechner seinen Nutzen hat

Biologieunterricht und Nachhilfeplattformen nutzen einen Allelhäufigkeit-Rechner, damit Lernende aufhören, den rezessiven Phänotypanteil als q zu behandeln oder drei Genotypprozente zu mitteln, als wären sie Allele. Arbeitsblätter der Populationsgenetik und Erhebungen des Artenschutzes brauchen ein deterministisches Orakel, das eine negative Einfügung ablehnt, statt still eine Häufigkeit größer als eins zu veröffentlichen. Inhaltseiten, die für Allelhäufigkeit-Rechner rangieren, profitieren von einem lebenden Steuerelement, dessen kostenloser Browserpfad mit dem vorausbezahlten Automatisierungspfad auf demselben reinen Modul übereinstimmt.

Eine fehlgeschlagene Prüfung wird nicht berechnet. Verwandte Suchen nach einem Punnett-Quadrat, einem Chi-Quadrat-Freiheitsgradschritt oder einer Hardy–Weinberg-Tafel erwarteter Genotypen sind andere Absichten: bleiben Sie auf dieser Seite, wenn die Frage nur die Allelfrequenzen sind, die aus den Zählungen folgen, die Sie bereits haben.