Khi-deux génétique

Un test du khi-deux d’adéquation en génétique demande si la descendance dénombrée concorde avec une attente mendélienne telle que 3:1 ou 9:3:3:1. Avant de consulter une valeur critique, il faut les degrés de liberté, et dans ce cadre ce nombre suit une règle fixe : le nombre de classes phénotypiques moins un, moins les paramètres estimés à partir des mêmes effectifs. Ce calculateur de degrés de liberté du khi-deux génétique accepte le nombre de classes (deux pour un monohybride, quatre pour un dihybride, huit pour un trihybride), un rapport attendu facultatif et un nombre facultatif de paramètres estimés, puis renvoie df = k − 1 − m avec la formule appliquée, un avis de correction de Yates lorsque df vaut un, et un schéma mendélien nommé lorsque le rapport est un cas de manuel.

Ce que les degrés de liberté signifient dans un khi-deux génétique

Les degrés de liberté d’un khi-deux d’adéquation en génétique répondent à une seule question : combien de morceaux d’information indépendants restent après que le total d’échantillon et les paramètres ajustés ont pris leur part. Si vous classez la descendance en k classes phénotypiques, ces effectifs doivent sommer la taille d’échantillon, si bien que seuls k moins un des effectifs peuvent varier librement.

C’est pourquoi un tableau monohybride 3:1 à deux classes a un degré de liberté, un tableau 1:2:1 de dominance incomplète à trois classes en a deux, et un tableau dihybride 9:3:3:1 à quatre classes en a trois. La même soustraction s’applique à un test-cross 1:1 ou 1:1:1:1, aux effondrements épistatiques tels que 9:3:4 ou 12:3:1, et à un tableau trihybride à huit classes 27:9:9:9:3:3:3:1, qui a sept degrés de liberté lorsque le rapport est entièrement spécifié d’avance.

Lorsqu’un généticien estime un paramètre à partir des mêmes effectifs — une fraction de recombinaison, une fréquence allélique ou un coefficient de viabilité — chaque estimation indépendante coûte un degré de liberté de plus, si bien que la formule de travail est df égal à k moins un moins m. Ce calculateur effectue cette soustraction et rien de plus : il ne calcule pas la statistique du khi-deux, ne consulte pas une valeur p et ne regroupe pas les cellules clairsemées à votre place.

Regrouper deux classes parce qu’un effectif attendu est tombé sous cinq est une décision de données que vous prenez d’abord ; vous envoyez ensuite le nouveau nombre de classes. La correction de continuité de Yates se discute d’ordinaire lorsque df vaut un ; la réponse signale ce cas afin qu’un compte rendu de laboratoire puisse la mentionner sans traiter la correction comme automatique.

Employer le mauvais df est la façon la plus courante qu’un jeu d’effectifs correct échoue encore à la comparaison avec la valeur critique du manuel, d’où l’existence d’une étape dédiée aux degrés de liberté en génétique, distincte d’un moteur khi-deux complet.

Où un calculateur de ddl du khi-deux génétique gagne sa place

Les salles de biologie et les plateformes de tutorat utilisent un calculateur de degrés de liberté du khi-deux génétique pour que les apprenants cessent d’écrire df égal à quatre pour un problème 9:3:3:1 simplement parce qu’ils ont compté quatre colonnes. Les générateurs de préparation d’examens ont besoin d’un oracle déterministe qui refuse un collage à une seule classe et qui soustrait une fraction de recombinaison ajustée au lieu de renvoyer en silence k moins un lorsque l’énoncé demandait k moins deux. Une validation en échec ne consomme pas le solde.

Les recherches de la statistique du khi-deux, d’un échiquier de Punnett ou d’une valeur critique sont d’autres intentions : restez sur cette page lorsque la question porte seulement sur le nombre de degrés de liberté d’un tableau génétique d’adéquation.