طول البروتين من mRNA
اعرف طول البروتين من الرسالة وحدها: تسلسل مرمِّز من 300 نيوكليوتيد يضم 100 كودون ويعطي بروتينًا من 99 حمضًا أمينيًا، لأن كودون التوقف لا يضيف أي حمض. مجانية في متصفحك.
- مجاني
- يعمل في متصفحك
- دون تسجيل
- بياناتك لا تغادر جهازك
شغّل الأداة مجانًا
مثال محلول
- طول الحمض النووي الريبي المرسال
- 300
- طول UTR5
- 0
- طول UTR3
- 0
- الطول المشفر
- 300
- عدد الكودونات
- 100
تحوّل حاسبة طول البروتين من mRNA طول الرنا المرسال بالنوكليوتيدات إلى عدد الأحماض الأمينية في الببتيد المتعدد الذي يرمّزه، بعد استبعاد كودون التوقف الذي لا يحدّد أي بقايا. تقرأ الريبوسومات التسلسل المرمِّز في ثلاثيات غير متداخلة: يصير كل كودون عدا توقف النهاية حمضاً أمينياً واحداً، ويُحسب كودون البدء ميثيونيناً أو فورميل ميثيونين. أدخل طول mRNA بالنوكليوتيدات، وإن عرفتها فأطوال المنطقتين غير المترجمتين 5' و3' حتى يُقسم إطار القراءة المفتوح وحده على ثلاثة.
لماذا طول البروتين هو النوكليوتيدات المرمِّزة مقسومة على ثلاثة ناقص التوقف
تُقرأ الشفرة الوراثية في ثلاثيات غير متداخلة. يُمسح الرنا المرسال من كودون بدء، هو AUG في الغالب، إلى أول كودون توقف في الإطار (UAA أو UAG أو UGA). يحدّد كل كودون بين هذين الطرفين حمضاً أمينياً واحداً؛ يستدعي كودون الإنهاء عامل الإطلاق ولا يضيف بقايا.
إذن طول البروتين بالأحماض الأمينية هو عدد كودونات إطار القراءة المفتوح ناقص واحد. وبالمثل، إن كانت L طول التسلسل المرمِّز بالنوكليوتيدات بما فيها التوقف، فطول البروتين هو (L / 3) − 1. تسلسل مرمِّز من 300 نوكليوتيد هو 100 كودون ويرمّز 99 حمضاً أمينياً؛ وتسلسل من 900 نوكليوتيد يرمّز 299 حمضاً أمينياً.
يُحسب كودون البدء: يرمّز الميثيونين، أو N-فورميل ميثيونين في الجراثيم والعضيات، فهو بقايا حقيقية عند الطرف الأميني حتى إن قُطعت لاحقاً. لا تُقسم المناطق غير المترجمة على ثلاثة. يحمل mRNA حقيقي النواة الناضج عادة قبعة 5' ومنطقة UTR 5' والتسلسل المرمِّز ومنطقة UTR 3' وذيلاً متعدد الأدنين.
يُترجم إطار القراءة المفتوح وحده. إن لصقت طول النسخة الكاملة دون طرح مناطق UTR حسبت حمضاً أمينياً زائداً لكل ثلاثة نوكليوتيدات غير مترجمة. تطرح هذه الحاسبة أولاً أطوال UTR 5' و3' الاختيارية، ثم تشترط أن يكون الطول المرمِّز المتبقي مضاعفاً موجباً للثلاثة ولا يقل عن ستة نوكليوتيدات (كودون بدء وكودون توقف).
لا تترجم تسلسلاً حرفاً حرفاً، ولا تتنبأ بمواقع بدء بديلة، ولا تنمذج انزياح الإطار أو إعادة الترميز بالسيلينوسيستئين. تجيب عن سؤال الكتاب والتعليق: بطول mRNA هذا، ما طول البروتين المرمَّز بعد استبعاد كودون التوقف؟
أين تبرّر حاسبة طول البروتين من mRNA استخدامها
تستخدم صفوف الأحياء ومنصات الإرشاد حاسبة طول البروتين من mRNA كي يراجع المتعلمون ورقة (n / 3) − 1 الكلاسيكية دون نسيان إسقاط كودون التوقف أو معاملة كودون البدء خطأً على أنه غير مرمِّز. تحتاج مولّدات التحضير للامتحان عرّافاً حتمياً يرفض طولاً غير قابل للقسمة على ثلاثة بدل قصّ انزياح إطار في صمت قد يقبله مصحّح معطوب. تستفيد مواقع المحتوى التي تتصدر بحث حاسبة طول البروتين من mRNA من ودجة حيّة يطابق مسارها المجاني في المتصفح مسار الأتمتة المدفوع مسبقاً على الوحدة النقية نفسها.
لا يستهلك التحقق الفاشل الرصيد. بحث تقدير البقايا من الكتلة الجزيئية أو الترجمة كودوناً كودوناً مقاصد أخرى: ابقَ في هذه الصفحة عندما يكون الإدخال طول mRNA بالنوكليوتيدات والإخراج عدّ الأحماض الأمينية بعد استبعاد التوقف.
حالات الاستخدام
فحوصات سلامة في تعليق ORF
الأنابيب التي تعرف طول النسخة وأحجام UTR تؤكد عدّ الأحماض الأمينية المتوقع قبل تخزين الببتيد المترجم.
الأسئلة الشائعة
لماذا يُطرح كودون التوقف؟
كودونات التوقف (UAA وUAG وUGA) تُنهي الترجمة ولا ترمّز حمضاً أمينياً. تسلسل مرمِّز من 100 كودون يعطي إذن 99 بقايا لا 100.
هل يُحسب كودون البدء حمضاً أمينياً؟
نعم. يرمّز AUG الميثيونين (أو N-فورميل ميثيونين في الجراثيم).
ماذا لو لم يكن طول mRNA قابلاً للقسمة على ثلاثة؟
باقي نوكليوتيد أو اثنين ليس مجموعة كودونات كاملة، لذلك لن تخترع الحاسبة طول بروتين مقرَّب.
كم حمضًا أمينيًا يرمّز mRNA طوله 300 نيوكليوتيد؟
يرمّز 99 حمضًا أمينيًا إذا كانت النيوكليوتيدات الـ300 كلها تسلسلًا مرمِّزًا. القسمة على ثلاثة تعطي 100 كودون، ويُستبعد كودون التوقف الأخير لأنه لا يضيف أي حمض.
هل أُدخل المناطق غير المترجمة في الطول؟
أدخل الطول الكامل للرسالة، وإن كنت تعرفها فأدخل أيضًا طولي المنطقتين غير المترجمتين عند الطرفين 5' و3'. تُطرحان أولًا، فلا يُقسم على ثلاثة إلا إطار القراءة المفتوح.
أدوات ذات صلة
للمطوّرين — الوصول عبر API
كل ما في هذه الصفحة متاح برمجيًا. هذا القسم موجّه للفرق التقنية التي تريد ربط الأداة بأنظمتها الخاصة؛ بقية المستخدمين يمكنهم استخدام الأداة أعلاه مباشرة دون الحاجة لقراءة ما يلي.
الـEndpoint
صادِق على طلبك بترويسة Bearer، وأرسل طلب POST واحدًا لتدخل مهمتك قائمة التنفيذ فورًا؛ ثم تستلم النتيجة عبر webhook أو رابط موقّع.
استدعِ الخدمة من بيئتك
curl -X POST https://api.kit.forhosting.com/bio/mrna-to-protein-length \
-H "Authorization: Bearer $KIT_KEY" \
-H "Content-Type: application/json" \
-d '{"mrna_length":300}'const res = await fetch("https://api.kit.forhosting.com/bio/mrna-to-protein-length", {
method: "POST",
headers: {
"Authorization": `Bearer ${process.env.KIT_KEY}`,
"Content-Type": "application/json"
},
body: JSON.stringify({
"mrna_length": 300
})
});
const { task_id } = await res.json();import os, requests
res = requests.post(
"https://api.kit.forhosting.com/bio/mrna-to-protein-length",
headers={"Authorization": f"Bearer {os.environ['KIT_KEY']}"},
json={
"mrna_length": 300
},
)
task_id = res.json()["task_id"]<?php
$res = file_get_contents("https://api.kit.forhosting.com/bio/mrna-to-protein-length", false, stream_context_create([
"http" => [
"method" => "POST",
"header" => "Authorization: Bearer " . getenv("KIT_KEY") . "\r\nContent-Type: application/json",
"content" => '{"mrna_length":300}',
],
]));
$task = json_decode($res, true);body := bytes.NewBufferString(`{"mrna_length":300}`)
req, _ := http.NewRequest("POST", "https://api.kit.forhosting.com/bio/mrna-to-protein-length", body)
req.Header.Set("Authorization", "Bearer "+os.Getenv("KIT_KEY"))
req.Header.Set("Content-Type", "application/json")
res, _ := http.DefaultClient.Do(req)مثال على الطلب
{
"mrna_length": 300
}مثال على الاستجابة
{
"task_id": "tsk_a1b2c3d4e5f6a1b2c3d4e5f6",
"type": "bio.mrna_to_protein_length",
"status": "queued",
"_links": {
"result": "/tasks/tsk_…/result"
}
}الواجهة غير متزامنة: تستلم task_id فور الإرسال، ويمكنك الاستعلام عن الحالة بمعدل طلب واحد في الثانية.
الأسعار
السعر معلن كما تراه: لا tokens ولا نظام نقاط؛ وإن فشلت المهمة فلن تُحاسَب عليها.
الحدود
max_nt | 3000000 |
الأخطاء
| HTTP | الرمز | المعنى |
|---|---|---|
401 | unauthorized | مفتاح الوصول مفقود أو غير صالح؛ تحقق من ترويسة Bearer في طلبك. |
402 | insufficient_balance | رصيدك لا يكفي لتنفيذ هذه المهمة؛ أعد شحن الرصيد ثم أعد المحاولة. |
404 | unknown_type | نوع المهمة المطلوب غير موجود في الكتالوج — راجع الاسم المرسل في الطلب. |
429 | rate_limited | تجاوزت الحد المسموح من الطلبات؛ انتظر قليلًا ثم أعد المحاولة. |
ملاحظات تقنية
تشغّل الوحدة الحتمية نفسها مشغّل المتصفح المجاني وواجهة API، فلا تختلف فحوصات الواجبات ونصوص التعليق على ما إذا كان تسلسل مرمِّز من 300 نوكليوتيد يعطي 99 بقايا أو 100.
عقد الإدخال وشكل الاستجابة وسلوك الخطأ
متى كان إطار القراءة المفتوح بما فيه التوقف جاهزاً لديك، أرسل ذلك الرقم وحده. بعد الطرح يجب أن يكون الطول المرمِّز ستة نوكليوتيدات على الأقل ومضاعفاً للثلاثة، وإلا تُرفض الطلب بدل التقريب في صمت، لأن باقي قاعدة أو قاعدتين انزياح إطار أو إطار مبتور لا بروتين أقصر. لا تُفوتر تلك الإخفاقات. اقرن العدد بعارض تسلسل خاص إن احتجت البقايا مكتوبة؛ هذه النهاية تحلّ الطول فقط ولا تُخرج ترجمة حرف واحد. أرسل جسماً JSON فيه العدد الصحيح الإلزامي mrna_length (الأسماء البديلة nt وnucleotides وlength وmrna_nt): طول mRNA بالنوكليوتيدات، من 6 إلى 3,000,000. الحقلان الاختياريان utr5_length وutr3_length (الأسماء البديلة utr5 وfive_prime_utr ثم utr3 وthree_prime_utr) يساويان صفراً افتراضياً ويُطرحان قبل القسمة حتى يُختزل طول النسخة الكاملة إلى التسلسل المرمِّز. قد يصل كل حقل عدداً صحيحاً JSON أو سلسلة أرقام؛ يفشل غياب mrna_length والسلاسل الفارغة وغير الأعداد الصحيحة والقيم خارج النطاق المنشور بـ invalid_input مع تسمية الحقل. عند النجاح يعيد الجسم mrna_length وutr5_length وutr3_length، ويبلّغ coding_length وcodon_count، ويضبط stop_codons_excluded على واحد، ويعيد protein_length بعدّ الأحماض الأمينية. تعيد formula عبارة protein_aa = (coding_nt / 3) - 1؛ وتضع formula_applied أرقام هذه الدعوة. مثال: mrna_length قيمته 300 يعطي coding_length 300 وcodon_count 100 وprotein_length 99. المدخلات نفسها مع utr5_length 50 وutr3_length 100 على mRNA من 450 نوكليوتيداً تنتج البروتين ذا 99 بقايا نفسه لأن 300 قاعدة فقط تبقى في الإطار.
أين تبرّر حاسبة طول البروتين من mRNA استخدامها
تعرف نصوص تعليق الجينوم وماسحات ORF غالباً طول نسخة أو تسلسل مرمِّز قبل أن تملك سلسلة ببتيدية؛ استدعاء API تحليل صغيرة يحوّل ذلك الطول إلى عدّ بقايا متوقع يمكن تثبيته أمام FASTA المترجم. ولأن التنفيذ تحليل خالص من المستوى A، تكلف كل دعوة ناجحة السعر الأساسي المنشور $0.002 بلا رموز نموذج ولا شبكة خارجة. أبقِ الأطوال داخل سقف النوكليوتيدات المعلن، وثبّت protein_length وformula_applied في الاختبارات، فتحصل على إجابات قابلة للإعادة من 99 بقايا لتسلسل مرمِّز من 300 قاعدة في الواجبات وإضافات LMS وأنابيب التعليق دون إقامة جدول ترجمة.
حالات التكامل
مراجعات صفّية لصيغة (n / 3) − 1
يدخل الطلاب طول mRNA أو تسلسل مرمِّز ويقارنون protein_length المُعاد بعدّ بقايا دون توقف أُنجز يدوياً قبل تقرير المختبر.
عرّافو امتحان وتثبيتات تمارين الرمز
يثبّت المصححون protein_length لمضاعفات الثلاثة وinvalid_input لأطوال انزياح الإطار غير القابلة للقسمة على ثلاثة.
أسئلة تقنية
كيف يُحوَّل طول mRNA إلى طول بروتين بالأحماض الأمينية؟
أرسل mrna_length بالنوكليوتيدات (اطرح مناطق UTR إن شئت بـ utr5_length وutr3_length). تعيد API القيمة protein_length = (coding_length / 3) − 1 مستبعدة كودون التوقف.
كم تكلفة حاسبة طول البروتين من mRNA؟
أداة المتصفح مجانية. تستخدم طلبات API رصيداً مدفوعاً مسبقاً بمقدار $0.002 لكل دعوة ناجحة؛ لا تُفوتر المدخلات غير الصالحة.