Calculadora del coeficiente de parentesco

El coeficiente de parentesco, escrito r o r de Wright, es la fracción esperada de alelos que dos individuos comparten idénticos por descendencia porque los caminos de pedigrí los unen a través de antepasados comunes. Los consejeros genéticos, los criadores de ganado, los genetistas de conservación y los estudiantes de genética cuantitativa usan ese único número para comparar un pedigrí esbozado con los valores de libro de padre e hijo, hermanos completos, medios hermanos, abuelo y nieto, tío y sobrina, o primos hermanos. Esta calculadora del coeficiente de parentesco acepta cada cadena independiente de enlaces generacionales que une a las dos personas a través de un antepasado común, la consanguinidad opcional de ese antepasado y la consanguinidad opcional de los dos individuos focales.

Qué significa la r de Wright y cómo la producen los enlaces generacionales

Sewall Wright definió el coeficiente de parentesco para que un pedigrí se convierta en una probabilidad y no en un dibujo. Cada camino independiente que une a dos individuos a través de un antepasado común aporta un medio elevado al número de enlaces generacionales de ese camino, multiplicado después por uno más el coeficiente de consanguinidad de ese antepasado. Un padre y un hijo comparten un solo camino de un enlace, de modo que r vale un medio.

Los hermanos completos comparten dos caminos de dos enlaces, uno por cada progenitor, y esas dos aportaciones de un cuarto suman un medio. Los medios hermanos comparten solo un progenitor, así que un único camino de dos enlaces da un cuarto. Los primos hermanos comparten dos caminos de cuatro enlaces a través de un par de abuelos y reciben un octavo.

El coeficiente de parentesco φ es la mitad de r cuando ninguna de las personas focales está consanguínea; es la probabilidad de que un alelo aleatorio tomado de una persona sea idéntico por descendencia a un alelo aleatorio de la otra. Cuando alguna persona está consanguínea, la calculadora usa la identidad completa r igual a dos φ sobre la raíz cuadrada de uno más F_X por uno más F_Y.

Los caminos deben ser independientes: no cuente la misma cadena dos veces ni incluya bucles que pasen dos veces por la misma persona. Los gemelos idénticos se tratan como un camino de identidad de cero enlaces con r igual a uno, que es una definición y no un recorrido largo de pedigrí por antepasados más lejanos.

Quién usa una calculadora de parentesco

Las aulas de genética usan una calculadora del coeficiente de parentesco para que los estudiantes conviertan un esbozo de pedigrí en la r de Wright sin omitir un camino ni contar mal los enlaces a través de un abuelo. Los pedigríes de conservación de programas de cría en cautividad necesitan un oráculo determinista que devuelva parentesco y relación para seguir el parentesco medio sin montar una biblioteca de grafos completa por un puñado de caminos.

Las hojas de consejo genético y los complementos LMS se benefician de un extremo parse mínimo que nunca inventa segmentos IBD ni resultados de microarrays cuando solo se exige el método clásico de caminos. La validación fallida no consume saldo. Mantenga corta la lista de caminos, fije relationship y kinship en las pruebas y obtendrá cifras reproducibles de r de Wright para deberes, memorandos de apareamiento y trabajadores en el borde sin una base de pedigrí propia.