Calcolatore del coefficiente di parentela

Il coefficiente di parentela, scritto r o r di Wright, è la frazione attesa di alleli che due individui condividono identici per discendenza perché i percorsi di pedigree li uniscono attraverso antenati comuni. I consulenti genetici, gli allevatori, i genetisti della conservazione e gli studenti di genetica quantitativa usano quel singolo numero per confrontare un pedigree abbozzato con i valori da manuale di genitore e figlio, fratelli pieni, fratellastri, nonno e nipote, zio e nipote, o cugini primi. Questo calcolatore del coefficiente di parentela accetta ogni catena indipendente di anelli generazionali che unisce le due persone attraverso un antenato comune, la consanguineità facoltativa di quell'antenato e la consanguineità facoltativa dei due individui focali.

Che cosa significa la r di Wright e come la producono gli anelli generazionali

Sewall Wright ha definito il coefficiente di parentela perché un pedigree diventi una probabilità anziché un disegno. Ogni percorso indipendente che unisce due individui attraverso un antenato comune contribuisce per un mezzo elevato al numero di anelli generazionali di quel percorso, poi moltiplicato per uno più il coefficiente di consanguineità di quell'antenato. Un genitore e un figlio condividono un solo percorso di un anello, quindi r vale un mezzo.

I fratelli pieni condividono due percorsi di due anelli, uno per ciascun genitore, e quei due contributi di un quarto sommano a un mezzo. I fratellastri condividono un solo genitore, quindi un unico percorso di due anelli dà un quarto. I cugini primi condividono due percorsi di quattro anelli attraverso una coppia di nonni e ricevono un ottavo.

Il coefficiente di parentela φ è la metà di r quando nessuna delle persone focali è consanguinea; è la probabilità che un allele casuale preso da una persona sia identico per discendenza a un allele casuale dell'altra. Quando una persona è consanguinea, il calcolatore usa l'identità completa r uguale a due φ sulla radice quadrata di uno più F_X per uno più F_Y. I percorsi devono essere indipendenti: non si conti due volte la stessa catena e non si includano anelli che passano due volte per la stessa persona.

I gemelli identici sono trattati come un percorso di identità a zero anelli con r uguale a uno, che è una definizione anziché una lunga passeggiata di pedigree verso antenati più lontani.

Chi usa un calcolatore di parentela

Le aule di genetica usano un calcolatore del coefficiente di parentela perché gli studenti convertano un abbozzo di pedigree nella r di Wright senza omettere un percorso né contare male gli anelli attraverso un nonno. I pedigree di conservazione dei programmi di allevamento in cattività hanno bisogno di un oracolo deterministico che restituisca parentela e relazione per seguire la parentela media senza erigere una biblioteca di grafi completa per una manciata di percorsi. Una convalida fallita non consuma il saldo.

Si tenga breve l'elenco dei percorsi, si fissino relationship e kinship nei test e si ottengono cifre riproducibili della r di Wright per i compiti, i promemoria di accoppiamento e i worker al bordo senza un database di pedigree proprio.